Doğal ve kazanılmış bağışıklık arasındaki en önemli fark patojeni tanımada kullanılan reseptör tipidir. Doğal bağışıklık patern tanıyan reseptörlerle (PRR) uyarılır ve her bir reseptör mikroorganizmaya göre çeşitli özelliklere sahiptir. Kazanılmış bağışıklıkta ise antijen reseptörleri ile uyarılır; antijenleri tanıyan bu reseptörleri eksprese eden genler gen segmentlerinin bir araya gelmesi ve ardından somatik rekombinasyonla çeşitlenmesi sonucu oluşur. Çeşitlenene gen bölgeleri de farklı respetör repertuarlarının oluşmasının zeminini oluşturmaktadır. Antijen reseptörleri T ve B lenfositlerindedir. Patojene özgü reseptörü taşıyan hücre klonal seleksiyona gider ve bu özellik immünolojik hafızanın oluşmasında temel rol oynar. Tekrar etmek gerekirse, Her bir lenfosit tek bir özelliğe sahip antijen reseptörüne sahiptir, böylece seçilen lenfosit, klonal ekspansiyonla patojene verilecek cevabın genişlemesini sağlar.
Medzhitov R. Recognition of microorganisms and activation of the immune response. Nature. 2007 Oct 18;449(7164):819-26. doi: 10.1038/nature06246. PMID: 17943118.